Transmit のお気に入りをクラウド経由で同期することが可能です。
Mac App Store版の場合は、iCloud を利用した同期を行うことが可能です。
Transmit をまだ 1度も起動してい無い場合は起動させる
Transmit 環境設定を開く
一般タブを選択する
お気に入り設定の同期プルダウンメニューから同期先を選択する